故事背景:清朝順治二年，（公元1645年）明唐王朱聿建（明太祖九世孫）入閩，在禮部尚書黃道固、福建巡撫張肯堂、南安伯鄭芝龍等擁立下，於福州即帝位，建立反清政權，建號"隆武"。然而不久就被清政府瓦解。據說在城破之前，明唐王朱聿建將數十萬兩的黃金秘密藏在福建的武夷山中。。。。。。至乾隆十年（公元1745年），各地反清複明的聲浪不斷高漲，尤以福建的南少林、廣東的天地會為首，他們聯合江湖武林同道，準備掀起一場更大的暴風雨，給滿清王朝予以毀滅性的打擊。那有關明唐王朱聿建的黃金秘密的消息也開始在江湖流傳著。。。
與此同時，清政府也盡遣滿清高手悄悄南下，一股血腥殺氣首先在南方的武林中蔓延。。。。
故事年代:清朝乾隆十年（1745年）。
遊戲開始：清朝乾隆十年，風雲突變，在廣州城經商多年的方德為免全家卷入這場風暴中而應好友嚴湛之邀舉家遷往杭州。。。。。。
方世玉一家搬到杭州城不久，就發生了官府大牢被人劫獄之事，方德怕世玉出去惹是生非，叫管家方忠看住他，不讓世玉出門。交代完以後就去張羅新開張的興隆商鋪去了，他哪裏想到方忠早已經被世玉收買了，原來方忠嗜酒如命，隻要有酒他都好說。。。可是這次卻不同了，方忠死活不肯讓世玉出門，世玉沒有辦法，隻好提出用家裏最好的一瓶葡萄酒來交易，方忠這才答應下來，不過要求世玉在正午回來。世玉就去地窖，找到葡萄酒，將酒交給方忠，終於可以出門了，可是這時書童方桐匆匆忙忙趕來說有人踢場，在興隆商鋪搗蛋，世玉聽後急忙出門。
世玉趕到興隆商鋪後，見父親方德在和一青年聊天。原來是該人將前來收保護費的地痞趕走。一見麵，才知道原來眼前這位就是多年不見的小時玩伴洪熙官，兩人從又相逢都十分高興。。。兩人見方德受傷，便讓方桐先送方德回家休息。方德走後不久，地痞帶人又來，原來來的是風雷堂手下"狂刀"笑傲天。笑傲天口出狂言，說兩人能打敗他，便從今以後再也不來打擾興隆商鋪。世玉和熙官聯手將他打敗。趕走笑傲天後，熙官告訴世玉的住處(洪家村)後就要離去，多年不見的好朋友，世玉怎麼可能放過，熙官隻好告訴他要去幫好友胡惠乾一個忙，原來胡惠乾爹是染布坊的主人，因風雷堂看上此染布坊，欲霸占，胡惠乾爹不允，地契便被搶，人也被風雷堂手下打傷。今日胡惠乾邀洪熙官一起去風雷堂論理。世玉聽說此事，便也要一起去，熙官沒有辦法隻好答應，兩人就一起來到胡惠乾家。
在惠乾家裏，熙官介紹胡惠乾和世玉認識，三人就往風雷堂趕去，在門外將看門的兩個手下打翻便傳了進去，找到風雷堂堂主雷老虎之子雷人王評理，和雷人王話不投機，雙方正要動手，一少女出來喝住雙方，原來她是雷人王之妹，雷人王見妹妹出麵便隻好作罷，不滿離去。雷碧婷向三人抱歉，並將地契交給胡。三個好友見地契拿到了也就算了，就離開了風雷堂。在風雷堂門口三人聊了一會，店裏夥計李大頭跑來說方忠來找，叫世玉火速趕回家。世玉便和倆人告辭先回去看父親。
世玉回到家中見父受傷，方忠告知需要跌打丸，要世玉上街找藥店買藥去。
世玉到了仁慈堂，卻遇見母親苗翠花也在買藥，世玉以為母親已經知道父親受傷的事了，沒有想到苗翠花根本就不知道此事，世玉就告訴她說父親受傷了，苗翠花將一顆跌打丸交給世玉讓他先回家，說自己急事辦完後就回去。說完就離開了。。。世玉覺得奇怪，便偷偷跟著苗翠花想看她到底是去什麼地方？
漸漸的出了城，世玉看到苗翠花進入到路旁的一間土地廟裏，便跟了進去，進入後卻發現裏麵空無一人。。。走到供台邊隱隱約約聽到母親在和一男子的對話，說的都是一些陳年往事。但卻知道原來便是母親從大牢裏將這個人救了出來。世玉怕呆久了被發現，同時想到受傷的老爹便離開了土地廟回家去了。
世玉回到家中將跌打丸交給方忠，方忠告訴世玉，說外公苗顯來了，在後院裏，世玉便來到後花園見到外公，苗顯告訴世玉武當、峨嵋兩派被朝廷利用，欲去少林寺興師問罪，他要趕去，但有一個錦盒需要世玉轉交給母親，並再三叮囑一定要藏好，不可落到別人手上。
臨走時又交代若他無法趕回叫世玉務必在八月十五那天到蒲田鎮去找一個叫"瞎子張"的人。
苗顯走後，世玉正要去找娘，丫頭方妮叫住說父親方德找，世玉急忙過去，原來是方德的好友嚴善人到來和方德商議世玉和他女兒的婚期。原來嚴善人有一女，被風雷堂雷老虎公子雷人王看上，嚴善人不欲將女兒送進虎口，便想到好友方德。。。世玉對這門親事不滿，想去找洪熙官，剛想離開。。。這時，嚴家丫頭小蘭跑來，說風雷堂的人到家鬧事找小姐麻煩，方德隻好叫世玉去一趟。問明地點後，世玉朝嚴家走去。
世玉打敗守在門口的兩個小爪牙，進去。。。
見雷人王在威逼一姑娘，而姑娘也好無懼色，世玉料想那姑娘便是嚴善人的女兒嚴詠春就跳出解圍，自稱是姑娘的未婚夫，雷人王見又是他來壞事，大怒，世玉和雷人王戰鬥。。。雷人王被打敗忿忿不平離去，詠春對世玉卻不領情反說多管閑事，怪他自稱是她的未婚夫，要世玉向她道歉，世玉隻好將情況告訴詠春，詠春聽後傷心不己，要世玉不要娶她，因為她已經有了心上人了。。。這時方德和嚴善人趕到，世玉急忙跑掉。
世玉想到外公交代的事便回家看娘回來了沒有，結果沒有，世玉想會不會還在那土地廟，便往土地廟走去。到了土地廟時，聽到裏麵有打鬥聲，便進入，見幾人正圍著一大漢撕殺、大漢漸漸不支，世玉忍不住，剛要衝了上去，這時候又進來一個蒙麵女，兩人齊心救下大漢後，蒙麵女就離開了，那個大漢認出世玉的招式，兩人交談世玉知道這個大漢叫陳浩南，是苗翠花師兄，他現在的身份是天地會杭州分舵主。世玉見這個地方已經暴露，便想到洪家村的熙官。。。
世玉背起受傷的浩南，來到洪家村，找到洪熙官家。想不到浩南和熙官也是認識的。
浩南告訴他們天地會出了叛徒，現在廣東總舵及廣西分舵被毀，要他們去蘭桂枋旁邊的太白酒店的密室將一重要物品(名冊)拿出交給靈隱寺住持緣因大師。世玉和熙官將浩南藏到地窖中，倆人便往太白酒店趕去。
走到城門口，世玉想到還沒有將錦盒交給娘，便叫熙官一起先到家中。
到了世玉家門口，見方德和嚴善人進入，熙官見嚴善人也在世玉家便不肯進了，說在外麵等。。。世玉不解但也無奈，隻好自己進去，找到母親苗翠花，將外公苗顯給他的錦盒交給母親，苗翠花便知道是怎麼一回事了，告訴世玉她要去福州城找天地會總舵主陳家駱。世玉顯然對錦盒裏的東西十分好奇，但苗翠花就是不告訴他，世玉隻好抖出他已經知道母親劫獄的事，並揚言要告訴父親。苗翠花無奈隻好告訴世玉，原來這個錦盒裏的東西可以證明當今皇帝乾隆是漢人的證據，並叮囑世玉他們小心照顧浩南。正要離去。
這時方德進入告訴他們要和嚴善人去京城進貨，叫他們呆在家中別亂跑。。。
等爹和娘都走了，世玉便溜出門，找到在外麵等候多時的熙官，熙官問世玉嚴善人怎麼會在他家，世玉便將嚴善人欲將嚴詠春許配給他的事告訴他，見熙官臉色不對，也沒有多問。就一起到太白酒店了。
世玉和熙官兩人來到太白酒店後，發現門口有很多官兵把守，無法進去。熙官想到太白酒店以前和染布坊曾為一體，也許胡惠乾會了解一些情況，便帶世玉一起去胡惠乾家。
兩人到胡惠乾家，將情況告訴惠乾，問惠乾有沒有辦法進入染布坊？惠乾很奇怪，細問之下才知道原來兩人是受人所托要去拿東西的。於是，惠乾告訴兩人，有一條密道可以通往太白酒店，但是密道的出入口隻有惠乾的老爹才知道。於是，三人便一起來到了惠乾老爹的染布坊。
當三人來到染布坊的時候，剛好碰見風雷堂的"霸槍" 陸之遜帶領著他的抓牙正在染布坊裏麵威逼惠乾的老爹將染布坊讓出來開煙館，於是，三人合力將陸之遜打跑。
打跑陸之遜以後，惠乾問胡老爹關於密道的事情，胡老爹告訴他們後院的水井就是通往太白酒店的密道，並且告訴他們這個密道隻能夠進入卻無法原路出來，要出來必須要經過太白酒店裏麵。交待完以後，
胡老爹便回家去了。三人來到了水井邊上，進入密道。
在密道裏麵，三人找到了花名冊，並且從另外一個出口來到了太白酒店後院的水井口。
三人剛剛從水井口出來，就碰上了幾個官兵，一陣搏鬥，將幾個官兵打趴下，三人衝進太白酒店大廳，又碰上了納蘭戍，納蘭戍一看見方世玉他們，立刻帶領官兵撲上來，一陣劈哩啪啦，納蘭戍被打趴下了，三人趁著沒有其他的官兵，離開了太白酒店。
三人離開太白酒店以後，決定先帶著花名冊到靈隱寺去找緣因大師，在靈隱寺內，三人碰見了嚴詠春，嚴詠春責怪熙官一直在躲避，同時要求熙官向詠春的爹提親，但是熙官卻因為詠春和世玉的事情而告知詠春自己配不上詠春而拒絕去提親，詠春非常生氣，當即含恨離開靈隱寺。這個時候方世玉才明白熙官和詠春之間的事情並且向熙官說明一切，熙官這才發現自己錯了，在世玉和惠乾的勸說下，立刻去追趕詠春。世玉和惠乾繼續去找緣因大師，兩人來到了靈隱寺的方丈室。
兩人進入方丈室內，找到了緣因大師，方世玉欲將花名冊交給緣因大師的時候，惠乾忽然出手阻撓，原來惠乾見過緣因大師，現在的這個緣因大師是假扮的。假緣因大師見自己的身份被拆穿後，立刻將三個徒弟叫進來，原來，這個假緣因大師是朝廷密探梁耀麟所裝扮的。一場混戰立刻展開。很快，梁耀麟和他的三個徒弟都被打敗，方世玉和胡惠乾借機離開靈隱寺。
在靈隱寺門口，兩人遇到熙官，世玉將情況告知熙官，熙官也告訴世玉他們自己沒有追上詠春並且一直擔心詠春不肯原諒自己，方世玉和胡惠乾的一陣安慰，才使熙官的心情稍微恢複平靜。三人決定先回熙官家，將事情告訴陳浩南。
到了熙官家的地窖裏，方世玉將事情的經過告訴陳浩南，陳浩南深感事情的嚴重，於是便拜托他們三人到蘇州的震威鏢局將花名冊交給鏢局的總鏢頭趙猛，並交給世玉一個戒指當信物。三人正要出了洪家村，世玉想到將陳浩南一人留下不妥，便安排熙官和惠乾留下照看，接著自己一人便離開杭州，前往蘇州。
走到途中，方世玉遇到先前在土地廟內有一麵之緣的蒙麵女子正在和一群人爭吵，仔細一聽才知道，原來這群人意圖強搶民女賣到妓院，而這群人正是風雷堂的人，領頭的就是風雷堂的鐵驕嵐，方世玉怒火中燒，當即和蒙麵女子一起將這群人渣一起打跑，救下了被強搶的民女並且知道還有很多的民女被抓走，現在還下落不明。送走眾位民女之後，方世玉問及蒙麵女子的芳名，蒙麵女子不想告訴世玉，世玉對於蒙麵女子無法告訴真名而無奈，準備離開，卻發現和蒙麵女子的方向相同，一問才知道原來蒙麵女子要去蘇州救其他女子的，於是，兩人結伴而行，雙方也相互諒解。
兩人來到蘇州城，正準備分手，蒙麵女子忽然提出要世玉幫助她一起去青龍幫搭救其他的女子，方世玉有要事在身，但是依然答應了蒙麵女子的請求並約好在青龍幫的門口會麵。雙方約定以後，方世玉就朝著震威鏢局前進了。
方世玉來到震威鏢局門口，看見震威鏢局門口戒備森嚴，趙猛的女徒弟柳含春正守在門口，方世玉欲進入鏢局，卻受到柳含春的阻撓，雙方產生口角，正要動手的時候趙猛出現，於是，方世玉講明來意並且出示了信物戒指，便被請入鏢局內。
在鏢局內，趙猛得知方世玉的身份和浩南的情況後，便覺得放心許多。這時候方世玉將花名冊交給趙猛，並告訴趙猛天地會出現叛徒。趙猛便將花名冊交給柳含春並要柳含春到鄉下躲避，柳含春立刻帶著花名冊離開鏢局。
方世玉正要離開鏢局，見鏢局戒備森嚴，但是趙猛卻守口如瓶，不告訴世玉所發生的事情。這時候，青龍幫的彭岷和雷人王忽然闖入，欲要向趙猛索要鏢物，方世玉才知道原來風雷堂和青龍幫聯手，以價值極高的寶物向鏢局投鏢的同時暗中劫鏢，以此想將鏢局占為己有。趙猛答應雷人王他們在一定時間內將鏢物返還。這時，有一個鏢師進來告訴趙猛說日本人找到了，於是趙猛便要前去收拾日本人，方世玉要幫忙，卻被趙猛謝絕，方世玉無奈，隻好先離開鏢局，這時也想起和蒙麵女的約定便向青龍幫出發。
在青龍幫附近，方世玉遇到蒙麵女子，雙方於是一路打到大堂，打敗了左右護法以後，卻沒有看見人，兩人於是退回大堂外麵，抓到了一個幫裏麵的打手，追問之下才知道原來姑娘都被藏在小南山上的一個石洞裏麵了，這時候蒙麵女子才想起來小南山上確實有一個石洞是青龍幫的秘密據點，而方世玉卻開始對蒙麵女子的身份了有了興趣：她為什麼要蒙麵？她是誰？為什麼會知道那麼多事。。。但蒙麵女子還是不肯告知。於是，兩人繼續向石洞前進。
兩人打敗石洞門口的守衛，衝進石洞，發現青龍幫幫主彭矜宗和那些姑娘正在洞內，兩人合力打敗彭矜宗，將姑娘們放回家，這時候，蒙麵女子好像狀態不佳，但是方世玉卻沒有察覺到，兩人於是下山。
兩人來到山下，遇見了先前被救的兩個姑娘大姑和小燕，兩個姑娘告知她們就住在小南山腳下的杏花村，就在這個時候，蒙麵女子忽然毒發，方世玉隻好將蒙麵女子安放在兩個姑娘的家裏。
蒙麵女子的傷勢嚴重，兩個姑娘告知方世玉小南山上有一個柯神醫，醫術高超，就是性情古怪，讓方世玉去看看，或許還有救，於是，方世玉向小南山上神醫府去了。
方世玉到神醫府，遇到管家苗尾，苗尾告訴方世玉說神醫在睡覺不得打攪，但見世玉是外地人，便向他提了個條件：如果要見柯神醫，就要先幫助他送一封信給杏花村的阿鳳姑娘，並帶回回信。原來這個管家暗戀上阿鳳姑娘了，又擔心被別人知道笑話。。。救人心切的方世玉這時候想都不想就答應下來，趕緊再回杏花村吧。
方世玉回到杏花村，將情況告訴大姑和小燕，看她們有沒有辦法。。。小燕很快就將阿鳳找來，原來這個阿鳳姑娘也是被世玉和蒙麵女救出的，恩人受傷，三女自然是竭盡全力，很快寫了回信，然後交給世玉。世玉再次來到神醫府上，將回信交給了管家，管家看完回信以後非常高興，便將方世玉帶到柯神醫麵前。
方世玉見到柯神醫，將事情告訴了柯神醫，沒有料到，柯神醫的怪癖就是不替女人治病，方世玉苦苦哀求也沒有用，柯神醫將他打發出門，苗管家為方世玉的真情所打動，便告訴方世玉柯神醫有收集天下寶刀寶劍的癖好，他現在看中了趙猛的宋代的七星寶刀，如果有的話，就可以替蒙麵女子治病了。於是，方世玉立刻下山找趙猛要寶刀。
方世玉來到鏢局，得知趙猛帶領眾鏢師去碼頭找日本人算帳去了，便立刻趕往碼頭。
在碼頭，方世玉看見趙猛被日本人打敗，連忙上前解圍，並且打敗了日本人的領頭柳生殘，柳生殘挺不服氣的。這時候，一個自稱叫千百惠的姑娘出現說很欣賞世玉，欲和世玉交朋友，被方世玉拒絕，千百惠隻能恨恨離開。
趙猛很感謝方世玉的解圍，當得知方世玉要寶刀救人以後，慷慨的將寶刀送給了方世玉，方世玉道謝以後立刻回到小南山柯神醫府上，見到柯神醫，將寶刀送給了柯神醫，愛刀心切的柯神醫當即答應幫助方世玉救治蒙麵女子，並讓方世玉去找四大毒草，方世玉離開柯神醫府上，開始尋找毒草。
方世玉在小南山洞穴裏麵找到了其中的兩樣，還有兩樣要到藥店裏麵去購買，於是，方世玉便來到了蘇州藥店，卻發現另外的兩種藥都被千百惠買走了，而且千百惠還專門在這裏等買藥的人出現。更讓世玉吃驚的事還是千百惠告訴他青龍幫彭幫主隻是他的一個手下而已。。。這個女人到底是什麼來頭？想幹什麼？似乎還有什麼更大的陰謀。。。千百惠要世玉加入她的組織，彭幫主就的事作罷。世玉當然不肯，千百惠便約世玉在小南山腳下比武，世玉要贏她，她就將藥都給世玉；要是世玉輸，就必須要服從她，世玉接受這個挑戰。結果千百惠被打敗，但她要世玉答應幫她做一件事才肯將藥給他，世玉為救蒙麵女，被迫答應。方世玉得到兩樣毒草以後，便立刻回到神醫府。
在柯神醫那裏，方世玉得到了柯神醫配的解毒藥以後，立刻回到杏花村，將解毒藥給蒙麵女子服下，蒙麵女子終於被救活過來，而且對方世玉漸漸產生了感情。當蒙麵女子揭開麵紗出現在方世玉麵前，方世玉才知道，原來蒙麵女子就是雷人王的妹妹雷碧婷！雷碧婷和雷人王完全不同，因為她有一顆善良的心。
雷碧婷的傷勢已經好轉，兩人回到杭州，分手的時候，倆人竟有些難分難舍了，雷碧婷贈送給方世玉一隻玉哨，並且告訴方世玉以後想找她的時候可以到杭州城外的淨心庵去找她，隻要方世玉吹響玉哨就可以。
兩人就此別過，方世玉也連忙回到熙官家裏。
在熙官家裏，方世玉沒有沒有找到陳浩南和洪熙官，疑惑之際，嚴詠春進來了，兩人一邊聊天一邊等候，這個時候，忽然聽見門口惠乾的聲音，原來惠乾發現有人鬼鬼祟祟的在偷聽，兩人連忙奔出屋外，隻看見一個黑衣男子正在和惠乾糾纏，嚴詠春發現這個黑衣男子很麵熟，原來，黑衣男子乃大內三大高手之一的張節俊，外號"鷹眼"，擅長追蹤術。三人不敢怠慢，立刻聯手將"鷹眼"打敗。打敗"鷹眼"以後，三人都覺得熙官和浩南出事了，在舉足無措之際，詠春忽然想起這個人曾經在靈隱寺見過，於是，三人決定到靈隱寺去看看。
三人來到靈隱寺裏麵，赫然發現梁耀麟正在拷問熙官，三人合力打敗梁耀麟，梁耀麟立刻召集救兵，於是，大內總管葉赫圖泰便帶領著眾高手蜂擁而進，一場惡鬥，葉赫圖泰等人倉皇逃竄。三人順利的解救了洪熙官。洪熙官告訴世玉他們，陳浩南現在很安全，早已經被轉移到村長洪大爺家裏了，不料他們的談話卻被裝死的梁耀麟聽到。。。眾人離開靈隱寺前往村長家。
在洪村長家裏，一行人見到了浩南，方世玉將事情告訴浩南。大家看見浩南平安後，深感欣慰，於是大家商量第二天送浩南到福州城後，各自回家準備了。
第二天，眾人到世玉家集合後便一起來來到了洪村長家裏，發現浩南不見了，同時洪大爺倒在地上，大家預感不妙，就在這時候，風雷堂的四大金剛出現了，原來，洪大爺是他們殺的，看來浩南已經落到風雷堂了，大家義憤填膺一擁而上，消滅了四大金剛。打敗了四大金剛以後，眾人開始懷疑有內奸，方世玉更是懷疑惠乾有染，惠乾憤憤離去，洪熙官替惠乾開脫，方世玉覺得錯怪惠乾，遂讓熙官前去追趕，而自己到靜心庵找碧婷想辦法。
方世玉來到靜心庵門口，卻受到兩個尼姑的刁難，雙方大打出手，一場惡鬥，方世玉打敗了兩個尼姑。這時候，李小環出現，經過交手，李小環發現方世玉是少林弟子，更知道了苗翠花是方世玉的母親，李小環百感交集，也放過了方世玉。方世玉尋找碧婷未果，隻好離開，準備去找洪熙官。
方世玉在離開的路上，竟然碰見了碧婷，碧婷要方世玉到靜心庵後山的石洞等她，於是，方世玉來到後山石洞，見到碧婷，將浩南被劫的事情告訴碧婷並且請求碧婷能夠想辦法救人。碧婷答應了方世玉的請求，兩人合計好計劃以後，方世玉便離開石洞，回去找洪熙官。李小環這時候出現，她要碧婷哪裏別想去。
方世玉來到熙官家裏，遇見熙官和詠春，方世玉問及惠乾，才知道惠乾也被風雷堂抓走，方世玉頓感內疚，於是，方世玉要求大家到他家去商量救人的事情。
三人來到方世玉家，在大廳遇到方世玉的母親苗翠花，苗翠花將經過告訴方世玉他們，並要求方世玉他們一塊到少林去，方世玉告訴苗翠花，陳浩南被風雷堂抓走，同時也告訴翠花靜心庵的事情。苗翠花深感不妥，於是決定到靜心庵去打探究竟，方世玉等人隻有暫時留著等消息。
一會兒，苗翠花回來了，她告訴方世玉他們峨嵋派和自己家的恩怨、少林和峨嵋的恩怨以及少林、峨嵋、武當和風雷堂的關係。苗翠花越感到事情的危險性，決定再次搬家到福州的同鄉會去，同時叫人通知
相關的人，並且決定第二天和方世玉他們一起行動。大家合計完畢便各自休息去了。
第二天，一行人來到風雷堂，依照計劃，方世玉和苗翠花來到風雷堂側門，卻發現側門開著，雷碧婷不見蹤影，母子倆進入側門，發現石牢，這時候風雷堂手下出來阻撓，被母子倆打敗，母子倆進入風雷堂，打敗了看守，見到了浩南。苗翠花急忙上前，不料，這個浩南是假冒的，苗翠花中招倒地，原來陳浩南是青龍幫的彭岷假扮的，苗翠花中了他的迷藥！而雷人王也出現在那裏。方世玉救母心切，也被打暈。。。。。。
方世玉醒來的時候，發現自己正在地牢內，不覺為自己的母親擔心。就在這個時候，雷碧婷忽然進入，欲救方世玉出去，並告訴世玉苗翠花現在關在靜心庵。。。方世玉認為這一切是碧婷的陷阱，非常惱火，任碧婷如何的解釋，方世玉都不相信，於是，方世玉拋下碧婷，自己離開石牢。
方世玉離開石牢以後，決定先去找熙官，然後再去救母親，於是方世玉來到土地廟，遇見了熙官，說明了情況，熙官告訴世玉還是到靜心庵去看看吧。
幾個人來到了靜心庵，打敗了幾個尼姑和道士，一路闖進靜心庵的大廳，遇見了李小環，方世玉向李小環索要苗翠花，李小環卻說苗翠花已經被她放走，方世玉不信，雙方大打出手，李小環被打傷，這時候碧婷忽然進入，告訴方世玉李小環是自己的母親，而且先前已經是受傷在身了。同時也告訴方世玉，她已經照母親的意思將苗翠花藏到土地廟裏，這是的世玉心頭是一片茫然，想說什麼又不知道該怎麼說。。。。。。雷碧婷告訴世玉以後也再不想見到他，然後將世玉趕出靜心庵。世玉離開後，李小環告訴碧婷其實她的生父不是雷老虎而是失散了整整十八年的陳浩南，並告訴她浩南實際是被關在官府裏的，她現在已經將他救出並藏在安全的地方了。
方世玉等人隻好再到土地廟，果然見到了苗翠花，眾人很高興。苗翠花將整個事情的經過告訴大家後，原來浩南和惠乾實際是被關在官府裏的，但都已經被李小環救出叫大家放心並將一些往事告訴大家，原來李小環曾經是浩南的妻子。。。苗翠花決定叫大家一起去福州，而這個時候方世玉卻因為自己錯怪碧婷而懊悔不已，方世玉決定去靜心庵向碧婷陪不是，便想一個人留下，將母親交給熙官和詠春照顧。
苗翠花等人離開後，方世玉來到靜心庵，在路上碰見了去抓藥的李小環和碧婷，方世玉謝過李小環以後便請求碧婷的原諒，可是碧婷卻不原諒世玉，世玉百般求情，碧婷才稍有寬心。這時候，千百惠和柳生殘路過，千百惠要方世玉三天後到福州城外的歐冶池去找她。碧婷心疑惑，方世玉隻得將事情告訴碧婷，碧婷聽完以後，覺得很感動，方世玉告知碧婷自己以後將在福州同鄉會落腳，兩人匆匆分手，方世玉即刻前往福州同鄉會。
方世玉回到同鄉會，見到母親苗翠花，將事情的經過告訴了苗翠花，這時候，天地會的付總舵主於震海來訪，他向苗翠花索討要交給總舵主的錦盒，苗翠花這時才想起了錦盒，當時為了保險沒有帶在身上而是藏在家中的書房裏，遂叫方世玉到杭州原來的家去拿，並承諾拿到後便送過去，於震海便先回去了。苗翠花告訴方世玉錦盒的隱藏地點，並且告誡方世玉一定要親手將錦盒交給自己，於是，方世玉及其熙官一行人向杭州出發。
方世玉回到家裏，剛好遇見雷人王和青龍幫的青龍幫的青龍幫的彭岷，雙方大打出手，雷人王和青龍幫的彭岷被打敗，立刻叫出黑白兩道長，而雷人王則去通知伊奕大人。又是一場惡鬥，黑白兩道長被打敗，方世玉也在書房裏拿到了錦盒，一行人正要離開時候，雷人王、伊奕和拜因帶領眾高手趕到。伊奕根本不將方世玉等人放在眼裏，便命令滿族第一勇士拜因抓拿方世玉後救離開了，方世玉等人經過一番苦戰打敗拜因，趕緊離開杭州城。想不到在城郊，又碰到伊奕布下的陷井，關鍵時刻，胡惠乾趕到，惠乾告訴方世玉他們，風雷堂已經殺害了他父親和他姑媽一家上下，眾人憤慨之際，合力消滅了拜因和眾高手，雷人王倉皇逃竄。胡惠乾欲追趕，以圖報仇，被世玉等人阻攔，於是，幾人合計先回福州。
在回福州的途中，眾人見到武當三大弟子在追殺一個重傷的老尼，詠春認出那個老尼就是自己的師傅五枚師太，眾人連忙上前解圍，打跑了武當弟子。方世玉問及外公苗顯的下落，五枚師太告訴世玉苗顯可能已經落入白眉手中，還告訴世玉苗顯身上係著一個很大的秘密，不過沒有告訴世玉到底是什麼秘密。於是，詠春和熙官送五枚師太回少林，世玉及其惠乾繼續趕回福州。
回到福州同鄉會，沒有看見母親苗翠花，丫環方妮告知母親去接父親了，於是方世玉決定先休息再說。
第二天一早，丫環方妮告訴世玉惠乾有事情離開了，但是不知道去哪裏，方世玉無奈之下想起和千百惠的約定，應該去歐冶池一下，看這個姑娘玩什麼把戲。於是，方世玉朝著歐冶池出發。
來到歐冶池，千白惠已經在等他，千百惠告訴方世玉之所以到這裏來是要方世玉和人家比武的，方世玉覺得奇怪，於是跟著千百惠來到歐冶池外，見到了戚繼光後代戚少嵐。原來，千百惠看上戚繼光所著的《劍經》，便故意和戚少嵐打賭，如果千百惠贏了，那麼戚少嵐就將《劍經》送給千百惠，如果千百惠輸了，那麼就要將日本《柳生忍術大法》送給戚少嵐。戚少嵐派出了刁得勝等四個高手與方世玉過招，隻要方世玉過得了十招，那麼就算方世玉贏。很快的，方世玉不負眾望的過了十招，替千百惠拿到了《劍經》，方世玉答應替千百惠做一件事終於是完成了，便離開歐冶池。無事可做便回同鄉會吧。
方世玉回到同鄉會以後，丫環方妮告訴方世玉有人在等他，方世玉進去一看，原來是天地會的兩個兄弟，他們在等待苗翠花的錦盒，方世玉告訴兩人錦盒已經在自己身上，兩人才放心的離去。
第二天，方世玉起床就碰見昨天的兩兄弟，兩個兄弟是奉於震海的命令請方世玉到福州天地會裏的，世玉隻好去了。在天地會裏，於震海要方世玉交出錦盒，方世玉不肯，於震海竟然強搶，被方世玉打敗，於震海連忙改口是試探方世玉的武功而已。一番讚揚以後，方世玉便回到同鄉會。
回到同鄉會以後，方世玉碰見了熙官及詠春，熙官告訴世玉，已經將師太送到少林了，五枚師太中了白眉的毒掌，必須要武當的獨門解藥三心丸，才能救師太，而解藥要去找李小環拿。於是方世玉決定去找李小環拿解藥。當熙官問及惠乾，方世玉告訴熙官自己也不知道惠乾到底去哪裏，熙官忽然想到惠乾可能去報仇了，眾人大吃一驚，可是方世玉又不能去救人，熙官不解，方世玉便將錦盒的秘密告訴熙官，於是大家決定，由熙官和詠春去找惠乾，方世玉等苗翠花回來後就去拿解藥，並約好到時在土地廟碰頭。
不久，翠花和方德等人終於回來了，方德將世玉一陣臭罵後也沒有辦法，便和嚴善人進屋喝悶酒去了。方世玉乘機將外公交待找人、五枚師太、惠乾和錦盒的事情都告訴了苗翠花，這時候，天地會有人來通知，陳總舵主要見兩人，於是苗翠花和方世玉一起去見陳總舵主。
母子倆人見到陳總舵主，將錦盒交給陳總舵主，同時也知道了陳總舵主和當今的皇帝乾隆是親兄弟，陳總舵主告訴他們天地會出現內奸，要翠花將這錦盒送到南少林至善大師那裏保管，苗翠花想磨練一下世玉，便要世玉將錦盒交給南少林至善大師，陳總舵主同意並要方世玉他們協助自己度過這個難關，母子倆點頭答應便離開天地會。 在路上，方世玉遇到先前歐冶池比武的刁得勝等四個高手，他們不服方世玉，認為當時規矩太多了，要和世玉重新比劃，苗翠花見有人想打兒子的主意，當然不依，母子倆齊心將他們打跑。隨後方世玉母子倆在福州分手。
方世玉來到蒲田鎮，找到瞎子張，經過玉佩的驗證，方世玉獲得了瞎子張的信任，瞎子張告訴方世玉八月十五那天到九蓮山上的隨緣亭，有人在等他，並且將一個東西交給方世玉要方世玉將東西轉交給那個人，同時交待世玉，辨認那個人的方式就是使用這個玉佩，對方也帶著一模一樣的玉佩。
方世玉剛剛走出瞎子張家，就在門口遇到柳生殘，柳生殘要瞎子張交出藏寶圖，瞎子張裝不知道，柳生殘欲對瞎子張痛下殺手，被方世玉阻擋，兩人激烈搏鬥，柳生殘不敵，落荒而逃，瞎子張告訴方世玉他身上的東西就是藏寶圖，但是卻沒有告訴方世玉到底是什麼藏寶圖，方世玉也隻好作罷。
方世玉離開瞎子張的住所，想到了陳總舵主的錦盒還沒有給至善大師，便到九蓮山南少林寺找至善大師， 一路奔波，來到了南少林寺，見到了至善大師，並且將陳總舵主交代的錦盒交給了至善大師；時天色已暗，且因為第二天便是八月十五，方世玉便應方丈之邀在南少林過夜，準備第二天去九蓮山上的隨緣亭。 第二天，方世玉來到了九蓮山上的隨緣亭，竟然發現千百惠就是自己要等的人，震驚之餘，千百惠告訴方世玉，這個藏寶圖記載著數十萬黃金的下落，方世玉吃驚不小，千百惠繼續告訴世玉，自己原來是大明太祖的九世孫－－－明唐王朱聿建的後人，本來自己得到這批黃金是想用來造反，但是她發現當今的皇帝還算是一個好皇帝，隻要戰亂，受苦受難的還是老百姓，所以就漸漸的放棄了這個念頭。臨走的時候千百惠將寶藏圖交給方世玉保管，世玉起初不肯答應，後來聽了自己千百惠的解釋以後也就答應下來了，原來這批寶藏對利欲熏心的日本人來說是很重要的，他們會不惜一切代價來奪取的。。。交代完千百惠便先離開了。方世玉見事情都已經辦完，便離開了蒲田鎮。
方世玉來到天地會，見到陳總舵主，告訴陳總舵主錦盒已經安置妥當以後，便回同鄉會看熙官他們回來了沒有。。
方世玉回到同鄉會，沒有看見翠花卻遇見碧婷來找方世玉，碧婷告訴方世玉峨嵋派掌門人雷蕩天已經到了杭州城，不久後武當白眉掌門人也會來；他們準備開始對付南少林了，而且特別揚言要對方世玉一家不利，同時也告訴方世玉惠乾被風雷堂抓走，還派了很多的高手在看守，但具體關在什麼地方碧婷也不是很清楚的；方世玉決定去杭州救惠乾，碧婷也要求前往，兩人踏上了杭州之路。
半路上，碧婷要方世玉到靜心庵後山石洞等待，自己去找母親李小環想辦法，方世玉順便將五枚師太的事情告訴碧婷，碧婷答應向李小環索討解藥。於是兩人分手，碧婷回靜心庵，方世玉則去土地廟找熙官。
方世玉來到土地廟，見到洪熙官，問及母親苗翠花，洪熙官告訴世玉苗翠花有事先走了，方世玉將半路上的事情告訴熙官，於是大家決定到石洞等碧婷。
不久碧婷來到石洞，將解藥三心丸交給詠春並告訴大家已經知道惠乾是被被關在靜心庵裏，同時還告訴世玉李小環要離開風雷堂，大家感到很高興，這時候，雷老虎忽然進入，原來雷老虎已經有所察覺，並告訴碧婷已經派人準備去除掉李小環，碧婷大怒，一場惡戰展開，方世玉他們打敗了雷老虎，碧婷卻放他一條生路；這時，世玉他們也才知道碧婷其實不是雷老虎的女兒，而是陳浩南和李小環的女兒，接著，碧婷救母心切便要世玉和他一起去，熙官和詠春乘機去靜心庵救惠乾，然後大家在福州見麵。
方世玉和碧婷風風火火的找到李小環藏身的地方，發現雷蕩天已經和李小環和浩南在動手，兩人立刻上前解圍，打敗了雷蕩天，雷蕩天逃之夭夭。陳浩南決定和李小環去隱居，並將碧婷托付給世玉，陳浩南同時告訴方世玉，天地會的叛徒就是於震海，並將於震海勾結風雷堂的親筆信交給世玉，之後，李小環和浩南便離開了，碧婷雖然不舍但也無奈。方世玉拿到親筆信，決定先回同鄉會，於是兩人向福州趕去。
兩人回到同鄉會，見洪熙官、嚴詠春和惠乾都已經平安回來，非常高興；熙官見世玉回來也就放心了。於是，準備上南少林將解藥交給五枚師太，同時惠乾也想去少林學武藝，眾人分手後，方世玉和碧婷便去找陳總舵主要將於震海的親筆信交給他。
方世玉和碧婷來到天地會，沒有找到總舵主卻遇見於震海，方世玉正要離開，總舵主回來了，方世玉將陳浩南隱居的事情告訴總舵主，並且將於震海的親筆信交給總舵主，指認於震海是叛徒，沒有想到總舵主不相信此事，而且還告訴世玉信是偽造的。方世玉無奈，隻好離開，回到同鄉會看娘回來了沒有。
數天以後，洪熙官回來了，帶來了五枚師太安然無恙的事情及其想去南少林學藝的事情。但是苦於大仇未報，遂請求方世玉一起去消滅杭州城知府高進忠已報大仇。方世玉當即答應，一行人向杭州出發。
眾人在路上碰見了陳總舵主，陳總舵主告訴方世玉他要去蘇州找乾隆及其於震海的親筆信的確是真的，隻是當時不想打草驚蛇而已。短暫的停留，方世玉一行人來到杭州。
來到杭州，熙官要先找一個叫做唐升的人，因為這個人是官府的人，熙官曾經救過他一命，隻有他才知道高進忠下落。
在城裏找到唐升，得知高進忠已經到蘇州的麗春院去陪一個神秘人物，於是一行人前往蘇州。
眾人來到麗春院，發現戒備深嚴，無法進入；於是方世玉便想先去找趙猛幫忙。，眾人來到鏢局，見到趙猛，趙猛得知眾人欲殺高進忠，便勸眾人等待陳總舵主回來再從長計議，這時候陳總舵主回來了，陳總舵主告訴大家已經得知明天乾隆要和高進忠等人去小南山遊玩，於是大家決定到小南山去埋伏。
第二天，乾隆和高進忠等人來到小南山，眾人蜂擁而出，一陣搏鬥，洪熙官終於報仇雪恨，可是總舵主和乾隆卻不見了，大家料想可能在山洞裏，於是，大家一起進入山洞。
山洞內總舵主和乾隆似乎已經談妥，總舵主決定和乾隆一起進京，眾人大驚，但是總舵主已經決定，眾人無奈。於是眾人決定先回福州。
回到同鄉會，方妮告訴方世玉，方德和嚴老爺被請到天地會了，方世玉知道於震海搞得鬼，於是眾人連忙趕到天地會。
到天地會，方世玉看見於震海和方德、嚴老爺等人，於震海要方世玉將錦盒拿出來，方世玉不肯，於震海便讓滿清高手出現，雙方一場惡鬥，於震海逃脫。眾人決定去杭州打聽苗翠花的下落，一行人立刻前往杭州。
在路上，眾人遇到千百家惠被追殺，原來，柳生殘為了獨吞寶藏而背叛千百惠，並且還請了他的師傅智禪師從日本下來，這時候，柳生殘及智禪師趕到，雙方一陣惡戰，打跑了柳生殘一夥人，千百惠非常感激。千百惠告訴世玉自己要回日本去，至於寶藏，就當作禮物送給方世玉，方世玉推托之際，千百惠離開。
方世玉來到靜心庵，打敗守衛以後，進去一看，發現雷蕩天正在逼問苗顯，看見方世玉進來，立刻將黑白道長叫出來，雙方大打出手，終於將雷蕩天等人打敗，救出苗顯及翠花。眾人回到同鄉會。
同鄉會裏麵，苗顯問及寶藏的事情，方世玉便將寶藏的事情一五一十的告訴苗顯，苗顯決定將這筆寶藏用來重建少林，並且建議大家到南少林去學武，而方德、翠花、嚴善人等人回廣州老家去，眾人都同意，於是，方德等人先離開。苗顯還要求方世玉去消滅少林的叛徒馬寧兒，並告訴世玉馬寧兒現在在福州，方世玉答應，同時將寶藏圖交給苗顯，大家約定清理門戶以後就去南少林。苗顯交待完畢以後，便離開，先行前往南少林。
苗顯走後，大家正在因為不知從何找起的時候，方世玉決定先去找戚少嵐打聽打聽，於是方世玉帶領眾人來到歐冶池。
在歐冶池，方世玉見到戚少嵐，戚少嵐告訴方世玉有個少林高手要和方世玉切磋切磋，方世玉將要找的人告訴戚少嵐，竟然以外的發現，這個高手就是馬寧兒，方世玉將事情挑明，戚少嵐決定不予幹涉，於是，方世玉等人開始清除馬寧兒，馬寧兒最終被消滅。方世玉告別戚少嵐後，帶領眾人前往南少林。
眾人來到路上一橋頭，遇見當地菜刀會的打手要敲詐他們過橋費，一陣痛扁之後，大家順利來到蒲田鎮。在蒲田鎮裏，苗顯、五枚師太及惠乾，已經在等著他們，由於少林寺不讓女眷入寺，五枚師太便帶詠春和碧婷到鎮上暫時先住下。苗顯告訴世玉他們白眉已經下了戰書，三個月後將到南少林找世玉他們報仇，苗顯要世玉他們去少林學般若掌、戰神刀法和韋馱棍三種少林寺絕學，隻有學會這三種武功才有可能和白眉抗衡。
眾人來到南少林寺，方丈至善大師收他們為俗家弟子並告訴他們白眉和他們比武是假，實際是要毀掉南少林寺的；要大家專心學武，不得私自出寺。
一個多月過去了，世玉和熙官因為惦記著碧婷和詠春，便想偷偷出寺，可是卻無法下山，惠乾告訴他們有一條密道可通山下並告訴給他們，世玉和熙官找到密道便來到蒲田鎮找到了碧婷和詠春互訴衷腸之後，碧婷和詠春便送他們回寺，在路上遇到了上次收過橋費的菜刀會手下，雙方又打了起來，世玉等人氣不過決定鏟除菜刀會，來到菜刀會，會長蔡誌傑見勢不妙急忙叫師叔出來，哈哈，想不到他的師叔竟是天地會的叛徒於震海，將兩人收拾後，世玉和熙官回到少林寺繼續學藝。
終於三個月快到了，方丈要驗證他們的武功，讓他們從銅人塔打出，經過努力，大家終於過關，並將三種絕招學成。不久，白眉前來挑戰，以為可以在二十招內將世玉他們打敗，沒有想到世玉他們可以抵擋得住，便露出了真實的麵目，使出了全部功力來，但世玉他們經過努力最後還是將白眉道人打敗。
【故事終】
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