最後正上方的房間內企鵝正在拿急凍槍防守，隻要我們露頭就會被攻擊，而且距離沒有辦法使用新道具，繞到企鵝的後麵開始使用，一直向企鵝靠近，因為使用了道具所以急凍槍處於超載狀態無法開槍。走到近處的時候X鍵把企鵝打翻在地。
企鵝用電流把巨大的Boss喚醒，開始戰鬥。這個Boss不能直接上去攻擊，會被電力反彈，唯一的方法就是看到地上三個發光的圓圈，這是 Boss充電的能源，按照提示站在能源上LT+X躲避Boss的錘擊，幾下這個能源就會壞掉，同樣的方法把剩下兩個能源摧毀後Boss跪地，上去X連擊。重複這個步驟兩次後Boss會狂暴，一樣的方法把Boss徹底解決掉。
開始對付企鵝，他用槍在遠處射擊，我們就盡量躲避子彈並且靠近企鵝，最後連續攻擊解決掉，十分的簡單。急凍人也被救了出來，這裏基本上萬事大吉了。
調查地上的血跡後獲得新的線索和目標，離開博物館後打開調查模式，跟著地上的血跡走，由於血跡之間距離很短，所以非常容易跟蹤。
在屋頂發現血跡終止，調查最後一攤血跡的時候出現女忍者，現在要來個追逐戰不能讓她跑掉。在屋頂和女忍者交手後Robin前來幫忙，但是貌似蝙蝠俠並不感激。
根據屏幕上的距離提示來到地下水道，仍然有指示標記所以很好找，遇到帶小醜帽子的敵人需要先B鍵眩暈再攻擊。來到十字口處會有提示使用新獲得的鉤鎖裝置，這裏要有技巧因為我們要到的入口在左側，所以鉤鎖要向右側的牆壁發射，然後利用蹬力反向飛到入口處，多嚐試幾次吧。
盡頭處砸開地麵的木板跳落有不少的雜兵，牆壁上的鎖箱解鎖後鐵門緩緩打開。這裏是以前我們來過的地鐵站，按照指示進入右側的小門內，蝙蝠俠突然感到一陣眩暈，不過還得繼續堅持。
用鉤鎖到達右邊有一群雜兵的平台，解決後開門進入高塔。幾個守衛劫持了人質，直接跳下清理幹淨，需要小心了下麵的敵人都是使用槍械的。救出護士人質後把她帶到安全的地方。從塔底的小門出去後蝙蝠俠再次眩暈，用遙控槍打開幾扇鐵門，中途有女忍者可以報仇。
在巨門前無法通過，對準地上的廢棄機器人守衛按住LB鍵獲取信息，但是到30%就無法繼續了，所以要在這個區域內找到其它的機器人守衛獲取信息。打開調查模式後看到藍色的守衛就去調查收集信息，當達到100%後可以通過錄像看到秘密入口的位置。
來到牆壁邊上打開秘密通道，需要一個忍者的劍來啟動，正好有忍者來找死順利打開通道。再次昏倒的蝙蝠俠竟然莫名的看到了父母的身影。堅持走到門前見到了刺客組織的女頭領，而此時蝙蝠俠的臉上已經出現症狀。
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