第2次超級機器人大戰OG中包含著許多隱藏要素，以下是已知隱藏要素的合集。
1.機戰D超級係主角機フォルテギガス：
47話「トーチカ奇襲」不讓ジョッシュ、リム參與戰鬥(一次都不能進入戰鬥畫麵，並且不可以塞進母艦裏)，並且6回合內到達指定地點入手本關SR
47話「トーチカ奇襲」結束時ジョッシュ、リム擊墜數70以上
48話入手，可能存在其他條件
2.魔裝機神係機體(サイバスター、ガッデス、ザムジード、ディアブロ、ヴァルシオーネ、グランヴェール、ガルガード)必殺技：
正樹路線：17話結束時讓マサキ、テュッティ、ミオ、プレシア四人擊墜數合計100以上
琉妮路線：17話結束時讓リューネ、ヤンロン、ザッシュ三人擊墜數合計75以上
單路線滿足條件後，合流後全部機體均取得必殺技
44話「特異點崩壊」マサキ、テュッティ、ミオ、ヤンロン四人習得必殺技回歸
46話「リューネ?カプリッチオ」プレシア、リューネ、ザッシュ三人習得必殺技回歸
ダイゼンガー內蔵武器追加
42話結束時ゼンガー擊墜數60以上，過關入手
T-LINKセンサー、Gテリトリー(芯片)
21話「黒焔の狩人」全部我方角色每人擊破2機以上(組隊時sub角色擊破的不算，必須是單人或者組隊時的main角色擊破才算)
ねじりハチマキ(芯片)
35話「漆黒の虎、氷の白刃」讓ブリット說得虎王機
勇者の印(芯片)
37話ミチル擊破至少3隻迅雷量產型
高性能電子頭脳
41話「妄念に操られし者(前篇)」用ゼンガー擊破ジンライ
42話「妄念に操られし者(後篇)」讓ゼンガー和レーツェル與ジンライ鄰接，然後用ゼンガー或レーツェル滿足勝利條件
SSPドリンク(芯片)
46話「リューネ?カプリッチオ」用マサキ救出プレシア，過關入手
鋼の魂(芯片)
49話「闘誌、炎に燃ゆる」過關時鋼龍兩個艦長レフィーナ&テツヤ分別擊墜數55以上
ブーストハンマー(武器)
39話「狼と犬達」ゼオラ、アラド、ラト三人任意一個單機或者作為組隊時的main角色擊破シエンヌ或把她打到撤退，過關入手
シシオウブレード(武器)
滿足以下條件40話過關入手
38話「四神邂逅」分別用ブリット/クスハ與雀武王發生戰鬥前對話2次
38話「四神邂逅」分別用ブリット/クスハ與雀武王發生戰鬥前對話2次
40話「蒼炎の逆鱗」分別用ブリット/クスハ與雀武王發生戰鬥前對話2次
40話「蒼炎の逆鱗」分別用ブリット/クスハ與雀武王發生戰鬥前對話2次
40話「蒼炎の逆鱗」過關時ブリット擊墜數50以上。
MTDMシューター(武器)
43話關內讓アイビス擊墜8機以上，總擊墜數50以上，過關入手
グラビトン?ランチャー(武器)
45話用イング擊墜エグレッタ，
結束時イング擊墜數70以上，
過關時輸送機滿HP
イング乘坐アッシュ時主動攻擊エグレッタ，導致アッシュ傷害到一定程度觸發劇情，過關入手
フリー?エレクトロン?キャノン(武器)
SP模式特典
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