在英雄無敵3中每兩種基本技能對應一種特殊技能，六種基本技能即對應了十五種特殊技能，但由於每個指揮官一般隻能學四種基本技能，所以也就隻能學六種特殊技能。讓我們來看下麵表格的詳細介紹。
| 指揮官特殊技能 | |
 | 降低防禦（Reduce Defense） 前提條件：大師攻擊＋大師防禦 基本作用：降低攻擊對象的防禦50％，類似比蒙的特技。 |
 | 恐懼（Fearsome） 前提條件：大師攻擊＋大師生命 基本作用：使敵方恐懼，即聖龍的特技。 |
 | 強力（Maximum Damage） 前提條件：大師攻擊＋大師傷害 基本作用：永遠最大傷害，類似天使、那加。 |
 | 不反擊（No Enemy Retaliation） 前提條件：大師攻擊＋大師魔法 基本作用：攻擊不受反擊，即那加、惡魔特技。 |
 | 射擊（Can Shoot） 前提條件：大師攻擊＋大師速度 基本作用：指揮官擁有遠程射擊能力。近身攻擊不減半。 |
 | 無限反擊（Endless Retaliation） 前提條件：大師防禦＋大師生命 基本作用：反擊次數無限，即獅鷲的特技。 |
 | 環擊（Strike Around） 前提條件：大師防禦＋大師傷害 基本作用：同時打擊周圍一圈所有敵人，相當於九頭龍、精神元素的特技。 |
 | 火盾（Fire Shield） 前提條件：大師防禦＋大師魔法 基本作用：自帶火盾，相當於火怪的特技，但反彈的傷害更大。 |
 | 格擋（Block） 前提條件：大師防禦＋大師速度 基本作用：30%幾率格擋物理傷害，事實上對死亡凝視之類的特技同樣有效。 |
 | 攻擊兩次（Attack Twice） 前提條件：大師生命＋大師傷害 基本作用：攻擊兩次，同十字軍。如果同時擁有射擊技能，則射擊兩次，同神射手，但近身攻擊僅一次，可以右鍵點擊防禦圖標選擇“melee attack”轉為近身攻擊，則可攻擊兩次。 |
 | 麻痹（Paralyze） 前提條件：大師生命＋大師魔法 基本作用：肉搏時50％幾率麻痹敵人三回合，類似於蠍獅，但幾率大多了。 |
 | 再生（Regeneration） 前提條件：大師生命＋大師速度 基本作用：每回合回複HP50點，類似於Heroes4中死亡騎士的特技。 |
 | 死亡凝視（DeathStare） 前提條件：大師傷害＋大師魔法 基本作用：肉搏時有幾率瞪死生命部隊，瞪死個數為指揮官LV/敵人LV。 |
 | 衝鋒攻擊（Distance Bonus） 前提條件：大師傷害＋大師速度 基本作用：每多行一格加5％傷害，同騎士。 |
 | 飛行（Ignore Obstacles=Fly） 前提條件：大師魔法＋大師速度 基本作用：無視障礙，同幽靈巨獸的特技。 |
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