Beacon Designer(實時定量PCR引物和探針設計輔助軟件) V8.14 官方版

Beacon Designer是一款非常好用的實時定量PCR引物和探針設計輔助軟件，通過多次驗證，為你節省驗證時間，節省經費。

軟件介紹

Beacon Designer™軟件靈活的解決了您實時定量PCR引物和探針的設計所需，並且通過了多次的驗證。您能夠通過BLAST搜索比對查找的序列以及尋找模版結構。當設計引物和探針時可以用到這些搜索的結果。設計過程中，與模板結構同源交叉的區域能夠避免隨意配對。

可用的設計選項

SYBR® Green 試驗設計

SYBR® Green 可能是實時PCR中最常用的化學分子。BeaconDesigner™可以設計SYBR® Green PCR引物，並且可以幫助您進行前導引物評估。您可以自主控製設計參數或者直接選擇由專家研究和交流後得到的默認值。同時您還可以針對特殊的實驗需要自己設置默認值。

除了可以在目的基因的任意位置中定位引物，Beacon Designer 還可以跨內顯子-內顯子或外顯子-外顯子設計引物。跨外顯子內含子連接的引物設計有助於選擇性地從gDNA中擴增得到cDNA。

HRMA 試驗設計

Beacon Designer™提供了一個檢測突變的高效方法。相對於以探針為基礎的基因型分析，HRMA更經濟實惠。該軟件運用一種特有的專利的算法，能夠設計出檢測突變的最好引物。

HRMA引物被設計將感興趣的突變設計於最短的擴增子，能夠檢測到解鏈溫度變化。引物避免了模板的二級結構，保證了有效的引物延伸。HRMA引物可以在NCBI上比對核苷酸信息來檢測特異性。此外，預引物和已經發表的引物同樣可以用來檢測。

雙標簽探針設計

Beacon Designer目前支持基於四種探針的化學反應：

TaqMan® 探針

使用Beacon Designe能夠幫助您研究不同基因表達以及單核苷酸多態性。同樣，您可以選擇LNA替代taqman探針，它比taqman探針更加穩定。Beacon Designer™可以幫助您設計甲基化的taqman探針。MethyLight 是一個高通量的分析，用來區別甲基化和非甲基化的DNA。通過Beacon Designer™，可以通過設定甲基化和非甲基化鏈，以及未處理DNA序列的寡核苷酸來適當地控製引物和探針的設計。您可以使用這些化學物評估pre-designed/published的引物或TaqMan®探針。設計完成之後，係統會根據不同的寡核苷酸屬性將設計的結果按性能排序並給出一個結果列表。

分子信標

設計或評估標準分子信標或用於NASBA分析的分子信標。NASBA是一個依賴引物的技術，用於單一混合物在一個溫度下的連續擴增。您可以設計單一溫度或多反應的分子信標。

Scorpions®

Beacon Designer支持Scorpions引物和探針的設計。Scorpions分析不依賴於探針的酶活性口袋。引物和探針在反應過程中緊密的偶聯。

FRET探針

Beacon Designer可以對之前設計的FRET探針進行再設計和評估。BeaconDesigner 中，FRET探針能與SYBR® Green偶聯在一起。

多重實時PCR分析

利用Beacon Designer™，您可以根據多重實時PCR分析設計TaqMan®，可多達5條包含參考基因選擇的序列。